Determinantes sociais demográficos para a variação do resistoma e do microbioma de uma comunidade multiétnica no sul da Malásia

Jul 26, 2023

npj Biofilmes e Microbiomas volume 9, Número do artigo: 55 (2023) Citar este artigo

443 Acessos

3 Altmétrico

Detalhes das métricas

A prevalência de bactérias resistentes a antibióticos no Sudeste Asiático é uma preocupação significativa, mas há pesquisas limitadas sobre o resistoma intestinal e sua correlação com o estilo de vida e fatores ambientais na região. Este estudo teve como objetivo traçar o perfil do resistoma intestinal de 200 indivíduos na Malásia usando sequenciamento metagenômico shotgun e investigar sua associação com dados de questionários compreendendo variáveis ​​demográficas e de estilo de vida. Um total de 1.038 genes de resistência a antibióticos de 26 classes foram detectados com uma taxa média de transporte de 1,74 ± 1,18 cópias de genes por célula por pessoa. A análise de correlação identificou 14 fatores ambientais, incluindo hábitos de higiene, parâmetros de saúde e colonização intestinal, que foram significativamente associados ao resistoma (PERMANOVA multivariada ajustada, p < 0,05). Notavelmente, indivíduos com culturas de levedura positivas exibiram um número reduzido de cópias de 15 genes de resistência a antibióticos. A análise da rede destacou a Escherichia coli como um importante centro da rede do resistoma, com uma correlação positiva com 36 genes de resistência a antibióticos. Nossas descobertas sugerem que a E. coli pode desempenhar um papel fundamental na formação da dinâmica do resistoma em Segamat, na Malásia, e sua abundância está fortemente associada aos hábitos de saúde e estilo de vida da comunidade. Além disso, a presença de levedura parece estar associada à supressão de genes de resistência a antibióticos.

A resistência antimicrobiana representa uma ameaça significativa à saúde global, projectada para resultar num encargo financeiro anual de 1 bilião de dólares e numa taxa de mortalidade global de 10 milhões até 20501. Embora as preocupações sobre a resistência aos antibióticos tenham surgido desde os primeiros dias da descoberta dos antibióticos na década de 19402 , o papel crucial dos antibióticos na terapêutica clínica e na indústria de alimentos para animais levou ao aumento da sua utilização ao longo do tempo3, resultando num aumento da resistência aos antibióticos em todo o mundo. Infelizmente, a abordagem tradicional de descoberta de novos antimicrobianos para combater a resistência é insustentável, uma vez que a taxa de tais descobertas diminuiu significativamente4. São necessários esforços urgentes para travar o rápido surgimento da resistência.

Um programa abrangente de gestão de antibióticos é amplamente considerado como a solução mais eficaz para gerir a ocorrência de resistência aos antibióticos num país ou região. Um elemento central para uma política eficaz de gestão de antibióticos é a vigilância regular dos antibióticos5. Embora a vigilância antibiótica seja habitualmente praticada em ambientes clínicos, raramente é utilizada em ambientes não clínicos6, como a nível comunitário, apesar da tendência crescente de infecções resistentes associadas à comunidade, incluindo MRSA e ESBL7,8. A falta de vigilância antibiótica a nível comunitário é especialmente verdadeira em países de baixo e médio rendimento, onde a resistência aos antibióticos é altamente prevalente9.

O Sudeste Asiático é reconhecido como um hotspot global de resistência aos antibióticos. Vários estudos destacaram o risco de aquisição de genes de resistência a antibióticos (ARGs) após viagens para a região10,11. Além disso, as comunidades do Sudeste Asiático apresentam algumas das maiores cargas de genes de resistência a antibióticos. Por exemplo, uma comunidade tailandesa relatou uma taxa de colonização fecal de 72,6% com Enterobacteriaceae produtoras de ESBL, uma das taxas mais elevadas alguma vez registadas12. Esta descoberta foi apoiada por uma meta-análise recente, que identificou o Sudeste Asiático como a região com a maior taxa de transmissão de Escherichia coli produtora de ESBL entre membros saudáveis ​​da comunidade13. Apesar da elevada carga de resistência aos antibióticos na região, faltam estudos abrangentes de perfil de resistoma. Entre os limitados estudos disponíveis, Pereira-Dias et al. (2021)14 descobriram uma ampla gama de genes de resistência a antibióticos em uma coorte de 42 indivíduos vietnamitas saudáveis. No entanto, o estudo foi limitado em escala e carecia de dados ambientais e de estilo de vida complementares, dificultando a sua interpretação. Mais recentemente, Li et al. (2022) relataram os perfis resistentes dos cingapurianos por meio da vigilância de esgoto urbano15. Embora a vigilância das águas residuais seja um método prático16, as suas conclusões dependem altamente do sistema de tratamento de águas residuais do país17, o que pode subestimar a carga real de resistência numa determinada área. Na Malásia, os estudos de resistoma baseados em metagenômica são limitados em tamanho e escala e não são projetados especificamente para fins de vigilância17,18. Além disso, muito do nosso conhecimento atual é baseado em estudos de resistência dependentes da cultura (por exemplo,19,20), que têm limitações inerentes e não podem fornecer uma visão abrangente do perfil do resistoma de uma comunidade. Esta lacuna de conhecimento dificulta a nossa compreensão da dinâmica da resistência aos antibióticos na região, da sua interação com o ambiente intestinal do hospedeiro e dos fatores de risco associados à aquisição da diversidade de ARGs na comunidade.